More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4345 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  256  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  256  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 121 aa  124  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  35.54 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 232 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 236 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3567  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.54 
 
 		 228 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  36.52 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 224 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 236 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  34.45 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 246 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 246 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 233 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 233 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 240 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  37.39 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.66 
 
 		 337 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 246 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 233 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 246 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0681  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 246 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 236 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.17 
 
 		 229 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 272 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.47 
 
 		 236 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 239 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 246 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 240 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.84 
 
 		 229 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 233 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3781  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 238 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.6 
 
 		 233 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.6 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 239 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 235 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>