53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3770 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 81 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  36 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  55.81 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 239 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3931  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  48.15 
 
 		 610 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 327 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  29.87 
 
 		 328 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  38.98 
 
 		 240 aa  43.9  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1542  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.78 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 262 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 179 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 370 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  41.46 
 
 		 262 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  41.46 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  47.5 
 
 		 380 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 		 425 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  48.65 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  50 
 
 		 131 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7229  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 470 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5522  hypothetical protein  40.74 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.821481  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  31.91 
 
 		 256 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>