More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1057 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1057  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 282 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.24 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.24 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  28.2 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.27 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  29.9 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.21 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.58 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  22.88 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4346  transcriptional regulator, IclR family  51.28 
 
 		 94 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  27.27 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.06 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  28.12 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  28.05 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  25.53 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5039  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>