68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0171 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 468 aa  963    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.86 
 
 		 442 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 432 aa  67  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0237  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3229  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.712082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.54 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2982  trehalose/maltose binding protein  24.53 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.3 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.59 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  30.36 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  34.48 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  22.01 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  23.84 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  24.5 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  30.53 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.91 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  27.01 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0604  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  20.68 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0862  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0791  extracellular solute-binding protein family 1  29.85 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0332  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 468 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.86 
 
 		 408 aa  43.5  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>