84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1305 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  100 
 
 		 115 aa  230  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.13 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  44.74 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  42.98 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.54 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.72 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.65 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  28.12 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  27.08 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.31 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.89 
 
 		 163 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  38.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  30.69 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.11 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  38.1 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  35.29 
 
 		 458 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  36.76 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  29.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3039  cupin 2, barrel  35.82 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762499  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  38.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.23 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  38.57 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  38.57 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  32.84 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.74 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0897  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.9 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  25.81 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  37.14 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  30.99 
 
 		 659 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 273 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4038  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.54 
 
 		 475 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  33.82 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  37.14 
 
 		 161 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  37.14 
 
 		 161 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  34.67 
 
 		 184 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 161 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 161 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  36.23 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2445  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2287  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2331  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2338  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2230  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  28.99 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.85 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 180 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 180 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4988  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 		 477 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>