228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1215 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1215  permease  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  65.52 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  44.35 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1447  hypothetical protein  52.17 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  35.4 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.5 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  34.45 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  30.58 
 
 		 261 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  42.06 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  33.94 
 
 		 251 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  36.96 
 
 		 2798 aa  60.1  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  30.58 
 
 		 261 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  30.58 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  30.56 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  35.05 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  29.57 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  36.97 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  27.43 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  38.05 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 		 286 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.89 
 
 		 299 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 		 268 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  31.73 
 
 		 251 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.98 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.42 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  30.77 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  33.62 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  33.9 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  28.97 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  30.56 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  28.8 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  28.18 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.64 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.19 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  31.19 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  33.66 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.69 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  30.21 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  30.93 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 		 270 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  30.93 
 
 		 267 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  30.93 
 
 		 251 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  31.96 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  31.09 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  34.91 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5037  protein of unknown function DUF81  32.97 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  0.114228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  30.56 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  30.61 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 		 270 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  30.93 
 
 		 251 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  30.56 
 
 		 262 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  30.56 
 
 		 262 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  32.48 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.69 
 
 		 254 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.51 
 
 		 291 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  34.48 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  31.82 
 
 		 315 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5038  hypothetical protein  39.62 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.337261  normal  0.113634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.1 
 
 		 307 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  32.41 
 
 		 304 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  34.09 
 
 		 303 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  31.67 
 
 		 304 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  29.13 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  30.28 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  36.89 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.55 
 
 		 300 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  29.46 
 
 		 291 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  32.58 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  23.75 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 		 257 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.44 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  25.69 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  29.46 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33.93 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  31.53 
 
 		 277 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  25.69 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>