More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3458 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3458  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0218436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  48.35 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  38.18 
 
 		 125 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  41.3 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  37.38 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  41.3 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2009  transcriptional regulator  46.07 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  34.86 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  37.25 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  36.63 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  36.63 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  36.63 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  36.63 
 
 		 206 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  36.63 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  37.25 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.36 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  46.59 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  34.78 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  34.82 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.96 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>