285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1853 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 512 aa  1061    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  60.32 
 
 		 506 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  57.31 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  57.79 
 
 		 502 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  55.82 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  53.51 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.42 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  36.81 
 
 		 505 aa  320  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  36.22 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  35.52 
 
 		 505 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  37.07 
 
 		 516 aa  313  3.9999999999999997e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 505 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  35.12 
 
 		 505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  35.32 
 
 		 505 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.96 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.99 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  36.26 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  34.91 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 504 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  34.77 
 
 		 523 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 523 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  34.46 
 
 		 504 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  34.46 
 
 		 504 aa  295  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  35.28 
 
 		 506 aa  286  5.999999999999999e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1038  histidine ammonia-lyase  33.96 
 
 		 515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  32.68 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 510 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  35.48 
 
 		 506 aa  279  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  36.97 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  34.27 
 
 		 513 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  31.61 
 
 		 515 aa  277  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  34.36 
 
 		 514 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  32.34 
 
 		 511 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  34.14 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  32.92 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  33.4 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.61 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  34.71 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  34.07 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  33.62 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  34.73 
 
 		 512 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 510 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  31.39 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  34.43 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  32.38 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  33.41 
 
 		 513 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  31.69 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  33.06 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 513 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 513 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  33.04 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  33.56 
 
 		 514 aa  269  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1653  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 513 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129126  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  32.97 
 
 		 510 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  33.05 
 
 		 530 aa  269  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 511 aa  269  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 513 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 506 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  33.9 
 
 		 511 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  33.93 
 
 		 518 aa  267  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  33.91 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  32.67 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  32.85 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  31.61 
 
 		 520 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  31.11 
 
 		 509 aa  266  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  32.98 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  31.47 
 
 		 519 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  32.41 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  34.05 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  33.46 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  34 
 
 		 515 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  33.13 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  33.06 
 
 		 515 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  31.23 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  31.89 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  34.47 
 
 		 515 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 		 510 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  34.21 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  31.31 
 
 		 532 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  31.31 
 
 		 532 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  31.37 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  31.06 
 
 		 519 aa  257  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  34.69 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>