More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1064 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  100 
 
 		 308 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  71.48 
 
 		 321 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  69.06 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0167  band 7 protein  72.73 
 
 		 312 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  28.32 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1007  band 7 protein  22.74 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1141  band 7 protein  23.61 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.56 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  26.76 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  26.3 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.3 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.3 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  26.3 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  26.3 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.3 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  26.3 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  25.93 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.18 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000566467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06060  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  23.76 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  26.76 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.11 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  25.11 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  25.68 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  24.66 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  26.09 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  26.26 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0057  band 7 protein  25.68 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.67 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.78 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  24.67 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.75 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  24.92 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06520  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  21.82 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000843271  normal  0.35726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.37 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  26.87 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  26.01 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  27.35 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  24.51 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.5 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  23.73 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  24.09 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0649  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  23.81 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  24.83 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  24.75 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  21.55 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  24.41 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  24.9 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.19 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11673  predicted protein  24.36 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  25.21 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.27 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  23.04 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.32 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03380  hypothetical protein  22.73 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  20.96 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  28.82 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  25.78 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  25.27 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.91 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.7 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  26.33 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.11 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  26.58 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  26.11 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  24.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  24.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  26.19 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  27.04 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  25.7 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  25 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  24.82 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  24.21 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  23.37 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.92 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  26.6 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  23.97 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  23.76 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.35 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  23.97 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.42 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  25.98 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.18 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  24.03 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  21.61 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  24.77 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2756  band 7 protein  22.89 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  26.06 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  23.85 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.65 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.65 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.41 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  20.82 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  23.26 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  24.57 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  23.1 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  24.31 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  25.86 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  24 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  23.1 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>