259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0081 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  100 
 
 
527 aa  1105    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  51.63 
 
 
524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  47.67 
 
 
516 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  47.87 
 
 
516 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  42.12 
 
 
526 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  44.08 
 
 
528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  39.47 
 
 
533 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  39.73 
 
 
533 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  39.43 
 
 
537 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  38.88 
 
 
519 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  41.96 
 
 
520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  39.09 
 
 
535 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  41.08 
 
 
536 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  39.73 
 
 
532 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  39.21 
 
 
535 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  39.06 
 
 
531 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  37.76 
 
 
530 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  38.05 
 
 
531 aa  334  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  35.11 
 
 
557 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  34.97 
 
 
541 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.46 
 
 
527 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  33.79 
 
 
507 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  33.64 
 
 
527 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 
529 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  31.32 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  31.08 
 
 
478 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30.02 
 
 
478 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  28.03 
 
 
638 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  29.41 
 
 
478 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  29.41 
 
 
478 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  28.77 
 
 
482 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.09 
 
 
646 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 
478 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 
478 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  28.51 
 
 
478 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  28.51 
 
 
478 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.76 
 
 
491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  28.6 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  28.31 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.77 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.37 
 
 
485 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.22 
 
 
490 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.37 
 
 
482 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.37 
 
 
482 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.37 
 
 
487 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 
478 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.96 
 
 
490 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.17 
 
 
482 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  23.79 
 
 
644 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  27 
 
 
490 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.39 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.58 
 
 
418 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.14 
 
 
503 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.27 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.22 
 
 
564 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  25.24 
 
 
572 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  27.13 
 
 
624 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.62 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.56 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.56 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.38 
 
 
495 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.69 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  24.15 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  22.75 
 
 
685 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  22.14 
 
 
560 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.01 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  21.88 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  21.56 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  22.82 
 
 
698 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  22.78 
 
 
492 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  21.44 
 
 
544 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.2 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  21.44 
 
 
559 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  22.31 
 
 
624 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.98 
 
 
536 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  21.62 
 
 
578 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.7 
 
 
413 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  22.06 
 
 
625 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  22.67 
 
 
576 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  46.67 
 
 
474 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  27.31 
 
 
592 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  24.5 
 
 
494 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  24.88 
 
 
1199 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  23.98 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 
490 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  22.96 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  38 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.51 
 
 
496 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  22.36 
 
 
499 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.14 
 
 
616 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 
493 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  24.8 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  23.47 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 
578 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.1 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  36.54 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50.98 
 
 
463 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.45 
 
 
598 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  36.78 
 
 
445 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>