63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3579 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  695    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  22.83 
 
 		 715 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  24.05 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  25.93 
 
 		 698 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  23.68 
 
 		 714 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  25.66 
 
 		 741 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  25.09 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  26.55 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  32.28 
 
 		 719 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  33.08 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  33.53 
 
 		 696 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  24.46 
 
 		 702 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  26.19 
 
 		 709 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  20.22 
 
 		 1124 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  25 
 
 		 701 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  23.66 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  21.43 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  33.08 
 
 		 699 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  24.89 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  32.33 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.33 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  31.39 
 
 		 1177 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  30.46 
 
 		 701 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  29 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  22.6 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 1171 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  30.15 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  25.13 
 
 		 720 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  24.38 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  23.49 
 
 		 948 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  30.71 
 
 		 709 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  23.92 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  25.67 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  22.71 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  24.73 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  24.46 
 
 		 756 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  21.15 
 
 		 844 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  21.15 
 
 		 847 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  21.15 
 
 		 847 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  38.17 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  25.13 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  21.91 
 
 		 720 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  28.37 
 
 		 736 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  26.88 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  19.21 
 
 		 824 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  20.47 
 
 		 838 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  27.34 
 
 		 825 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  27.64 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  31.46 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  28.12 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  25.56 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  26.88 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4021  hypothetical protein  22.43 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  31.09 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  26.88 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  26.88 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2470  hypothetical protein  25.5 
 
 		 176 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  27.78 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1169  peptidase M50  30.7 
 
 		 375 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0781  peptidase M50  30.7 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1506  peptidase M50  30.7 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  26.25 
 
 		 224 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  26.25 
 
 		 224 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>