More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1235 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 393 aa  818    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  69.09 
 
 		 390 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  56.64 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  47.49 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  47.48 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  47.47 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  46.29 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  46.75 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 387 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  39.11 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  36.24 
 
 		 383 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  36.8 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 386 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  37.4 
 
 		 386 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  37.67 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  35.81 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  37 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  37.13 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  35.64 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  36.19 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  36.59 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  36.59 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  38.13 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  38.85 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  36.46 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  38.22 
 
 		 386 aa  266  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  37.6 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  36.04 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  37.96 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  35.92 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  39.37 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  37.63 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  35.56 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  37.6 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  35.51 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  36.59 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  35.66 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  36.31 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  35.56 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  35.19 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.77 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  34.48 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  37.63 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  34.76 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.01 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  37.86 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.53 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  36.24 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  36.39 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  35.45 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  35.45 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  34.46 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  34.76 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  34.22 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  36.48 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  34.39 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  34.92 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  34.3 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  35.03 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  35.19 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  34.04 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  34.39 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  34.58 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  33.69 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  34.92 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  33.42 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  36.89 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  34.04 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  34.13 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  33.96 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  34.92 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  33.69 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  34.13 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0694  2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.71 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.519768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  33.16 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>