More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0385 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0385  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 766 aa  1557    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 		 773 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  20.87 
 
 		 779 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2734  AraC family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 764 aa  125  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000030307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  23.29 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.54 
 
 		 760 aa  84  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 548 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 365 aa  77.4  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  21.65 
 
 		 539 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  19.53 
 
 		 793 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1706  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 267 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  28.45 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  28.45 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 301 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  32.71 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  21.71 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  30.19 
 
 		 108 aa  63.9  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  23.74 
 
 		 272 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 273 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1416  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 276 aa  63.9  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.813304  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  21.68 
 
 		 534 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 298 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 766 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  29.03 
 
 		 304 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 556 aa  62.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  26.4 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  30.4 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 427 aa  62  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 543 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 299 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2187  AraC family transcriptional regulator  19.83 
 
 		 752 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.97772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5635  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 282 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  0.936217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  33.98 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2672  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1275  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 493 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 276 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  28.85 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3614  transcriptional regulator, AraC family  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.950607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  19.56 
 
 		 542 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 513 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  19.91 
 
 		 363 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  28.85 
 
 		 287 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2519  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 285 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>