More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0501 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  73.11 
 
 		 212 aa  322  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  67.92 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  70.53 
 
 		 208 aa  298  5e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  66.98 
 
 		 212 aa  297  8e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  68.45 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  65.05 
 
 		 220 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  48.08 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  50.75 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  50.25 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.61 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  47.09 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  49.49 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.17 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.25 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.23 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.37 
 
 		 211 aa  204  9e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  47.72 
 
 		 249 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  48.44 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  47.64 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  47.64 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  47.64 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  47.64 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  47.64 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  48.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.06 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  47.92 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  45.89 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  46.6 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  47.64 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  48.44 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.96 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.12 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  48.44 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.89 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  48.96 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.34 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  48.69 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  45.89 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  47.83 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.28 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.6 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  46.07 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  46.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  47.12 
 
 		 236 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  45.05 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  46.53 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  45.59 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  45.79 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  45.24 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  47.12 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  47.12 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.92 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  46.38 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.15 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  46.38 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  47.98 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  47.98 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  46.07 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  46.38 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  46.6 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  46.07 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  47.64 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  45.81 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  45.12 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.81 
 
 		 214 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  46.19 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  48.48 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  45.54 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  46.35 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  45.55 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  47.92 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  45.05 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  46.6 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  46.46 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.93 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  46.07 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  47.92 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  46.6 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  45.32 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  46.12 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  45.32 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.74 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  46.07 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.88 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>