More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0461 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  76.47 
 
 		 111 aa  167  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  71.17 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  71.17 
 
 		 111 aa  158  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  68.27 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  64.08 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  58.41 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  46.74 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  43.3 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 108 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  51.32 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  38.38 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.24 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.76 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  35.92 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.42 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0925  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0708087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  38.75 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  32.93 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  32.95 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3346  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.388028  hitchhiker  0.00866337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  38.81 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  32.05 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  43.4 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0065  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  34.09 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  42.37 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  34.07 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  34.04 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>