More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0457 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  43.43 
 
 
1064 aa  795    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  51.67 
 
 
1049 aa  989    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  46.08 
 
 
1186 aa  706    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  47.44 
 
 
960 aa  702    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  49.94 
 
 
923 aa  805    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  44.8 
 
 
1053 aa  855    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  49.55 
 
 
1183 aa  762    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.79 
 
 
1044 aa  758    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.91 
 
 
1041 aa  843    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  50.06 
 
 
1044 aa  780    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  43.98 
 
 
1201 aa  713    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  100 
 
 
1049 aa  2167    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  45.54 
 
 
965 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  48.72 
 
 
1492 aa  770    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  46.99 
 
 
1581 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  49.11 
 
 
1007 aa  945    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  50.33 
 
 
1023 aa  957    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  43.14 
 
 
1190 aa  619  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  34.68 
 
 
1200 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  50.74 
 
 
775 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  28.8 
 
 
644 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.73 
 
 
908 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.91 
 
 
1148 aa  131  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.45 
 
 
1067 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.5 
 
 
1004 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
1818 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.54 
 
 
798 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.32 
 
 
1345 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2655  hypothetical protein  35.39 
 
 
278 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589168  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.05 
 
 
942 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1037  hypothetical protein  43.37 
 
 
174 aa  118  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.17 
 
 
888 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.94 
 
 
997 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.49 
 
 
783 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.95 
 
 
1091 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 
762 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 
762 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  26.94 
 
 
1339 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.67 
 
 
1349 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  41.07 
 
 
251 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  25.98 
 
 
1002 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.64 
 
 
725 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 
911 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.46 
 
 
1150 aa  105  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.99 
 
 
417 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.79 
 
 
1237 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.28 
 
 
2194 aa  104  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 
416 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  23.82 
 
 
957 aa  104  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  37.57 
 
 
416 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25.54 
 
 
766 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.46 
 
 
951 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  37.85 
 
 
412 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.32 
 
 
773 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  27.49 
 
 
818 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  28.5 
 
 
1080 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.77 
 
 
2216 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.97 
 
 
887 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.63 
 
 
1086 aa  101  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  36.78 
 
 
766 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.7 
 
 
805 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  24.82 
 
 
1742 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.79 
 
 
649 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.45 
 
 
570 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  27 
 
 
1216 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  33.71 
 
 
273 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.23 
 
 
348 aa  95.9  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  33.97 
 
 
538 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 
348 aa  95.5  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  36.99 
 
 
468 aa  95.5  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 
267 aa  95.1  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.26 
 
 
614 aa  94  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.26 
 
 
439 aa  94.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.5 
 
 
291 aa  93.2  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.01 
 
 
292 aa  93.2  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  36.21 
 
 
263 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36.42 
 
 
444 aa  92.8  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  28.94 
 
 
437 aa  92.8  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  29.03 
 
 
344 aa  92.8  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.83 
 
 
293 aa  91.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.77 
 
 
801 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  36.99 
 
 
444 aa  91.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  36.05 
 
 
433 aa  91.3  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  32.65 
 
 
819 aa  89.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  35.09 
 
 
442 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  37.21 
 
 
447 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.75 
 
 
1174 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.98 
 
 
751 aa  89.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  35.59 
 
 
487 aa  89  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.24 
 
 
892 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  33.17 
 
 
852 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  35.59 
 
 
416 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
861 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  30.05 
 
 
951 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.51 
 
 
1104 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.81 
 
 
433 aa  87  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  32.52 
 
 
781 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  34.03 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.31 
 
 
1267 aa  85.1  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>