More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0555 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0555  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0413767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  46.43 
 
 		 316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02380  2-aminoethylphosphonate transport  48.2 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.174206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  34.56 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  41.77 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  35.86 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  36.82 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  35.06 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  38.1 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  35.46 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  35.32 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  33.22 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  31.83 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  33.08 
 
 		 342 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  37.08 
 
 		 349 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  37.08 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  32.89 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  32.39 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  32.56 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  33.33 
 
 		 352 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  32.39 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  33.33 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  36.11 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  37.08 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  37.08 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  36.07 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  34.39 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  35.68 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  36.07 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  35.95 
 
 		 371 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  30.16 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  33.21 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  31.68 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  34.03 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  30.45 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  37.97 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  35.54 
 
 		 396 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  31.15 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  32.67 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  35.51 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  31.19 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.73 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.58 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  35.51 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.87 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  36.12 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  28.89 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 387 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  33.46 
 
 		 361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  36.77 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 377 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  35.24 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.87 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  33.99 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.99 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  33.99 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  35.71 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 377 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 405 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  33.87 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.27 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  29.15 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  32 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  33.33 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.6 
 
 		 377 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  35.37 
 
 		 369 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  36.24 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  33.61 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  35.66 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  32.54 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 400 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.86 
 
 		 377 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  35.37 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.33 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  35.32 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 1057 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  35.32 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  34.96 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  35.44 
 
 		 374 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  28.83 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  35.39 
 
 		 363 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  29.45 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  32.64 
 
 		 377 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>