More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0480 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
377 aa  770    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  59.84 
 
 
395 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  56.02 
 
 
397 aa  428  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  51.34 
 
 
401 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  50.56 
 
 
386 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  46.13 
 
 
400 aa  326  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  33.6 
 
 
389 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
399 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
234 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.93 
 
 
552 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
567 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
567 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
585 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
572 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
568 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
568 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
606 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
572 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
623 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.37 
 
 
247 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
593 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
619 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
619 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
606 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
629 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  32.89 
 
 
568 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
246 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  33.48 
 
 
558 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
610 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  33.19 
 
 
575 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.89 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
575 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
571 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 
244 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  30.53 
 
 
563 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
220 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
244 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2752  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
252 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3919  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
256 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
573 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
573 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
259 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
252 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.94 
 
 
270 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  32.73 
 
 
273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4382  family 2 glycosyl transferase  29.51 
 
 
250 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267496  normal  0.107729 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
535 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 
255 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158581  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  32.03 
 
 
567 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0934  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
253 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.435482  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0792  glycosyl transferase, group 2  32.75 
 
 
253 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
222 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3997  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
262 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
536 aa  117  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
220 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0435  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
244 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111827  normal  0.816916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
220 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1332  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0116  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
242 aa  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
260 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2756  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
260 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1367  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
270 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000706147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
266 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2808  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
268 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
355 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3309  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
258 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  31.48 
 
 
377 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0436  hypothetical protein  30.45 
 
 
257 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.679077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  31.84 
 
 
374 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
261 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
229 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
448 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
239 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0311  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
256 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.82 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0323  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
256 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
313 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
344 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.92 
 
 
244 aa  92.8  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
243 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.92 
 
 
809 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
293 aa  89.4  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
227 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.39 
 
 
241 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
246 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
262 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
226 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>