More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0821 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  775    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  30.84 
 
 
459 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  30.8 
 
 
471 aa  140  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  28.44 
 
 
467 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.82 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  31.21 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  30.55 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
424 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  28.28 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  28.89 
 
 
451 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  27.21 
 
 
452 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  27.62 
 
 
434 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0467  major facilitator transporter  33.33 
 
 
359 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0594986  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
477 aa  123  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  29.26 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.39 
 
 
399 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.46 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.93 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.43 
 
 
399 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  27.02 
 
 
454 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.73 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.88 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.38 
 
 
399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  28.79 
 
 
479 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.38 
 
 
399 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  28.17 
 
 
468 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  28.17 
 
 
468 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.93 
 
 
468 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  36.67 
 
 
476 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.93 
 
 
468 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.93 
 
 
468 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.95 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.93 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  28.79 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  30.7 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  30.7 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  30.46 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.27 
 
 
399 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.16 
 
 
445 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.47 
 
 
479 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.01 
 
 
446 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  27.73 
 
 
432 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.72 
 
 
427 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  27.82 
 
 
457 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  28.53 
 
 
402 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.35 
 
 
434 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
423 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  27.47 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
472 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.38 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.38 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.22 
 
 
472 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.38 
 
 
443 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
443 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.08 
 
 
434 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
458 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
428 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.2 
 
 
432 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.15 
 
 
443 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
430 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.17 
 
 
432 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.01 
 
 
435 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  24.24 
 
 
447 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.14 
 
 
480 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
423 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.75 
 
 
460 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
404 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.72 
 
 
464 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.93 
 
 
412 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  27.25 
 
 
457 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.53 
 
 
433 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  26 
 
 
442 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
454 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  24.7 
 
 
476 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.53 
 
 
432 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  26 
 
 
442 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.76 
 
 
433 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.93 
 
 
432 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.53 
 
 
432 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
432 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  26.58 
 
 
382 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
433 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.17 
 
 
433 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.49 
 
 
474 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.27 
 
 
428 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.1 
 
 
432 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  28.92 
 
 
423 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.33 
 
 
436 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.92 
 
 
423 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
398 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  26.83 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>