More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2407 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  82.98 
 
 		 188 aa  329  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  80.21 
 
 		 193 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  80.75 
 
 		 195 aa  303  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  77.84 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  70.21 
 
 		 193 aa  288  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  65.22 
 
 		 193 aa  263  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  56.35 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  56.28 
 
 		 191 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 189 aa  188  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 		 195 aa  177  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  43.85 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 196 aa  154  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  43.09 
 
 		 189 aa  154  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  42.39 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  41.34 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 		 202 aa  150  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 		 189 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 198 aa  134  8e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  24.48 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  25.54 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>