More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1678 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 318 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  63.23 
 
 		 315 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  61.51 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  58.86 
 
 		 314 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  58.01 
 
 		 314 aa  358  6e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  56.27 
 
 		 317 aa  351  8.999999999999999e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  53.35 
 
 		 317 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  46.58 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  45.25 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  42.9 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  42.48 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  41.96 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  42.53 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  44.37 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.51 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.39 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  38.44 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  38.71 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 318 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.73 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  38.04 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  38.06 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  36.51 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  41.04 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  34.34 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  37.18 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  36.27 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  35.35 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1505  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.337969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  37.43 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  35.2 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  37.78 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  36.25 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.22 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  36.04 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0817  methionyl-tRNA formyltransferase  35.83 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  35.24 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  35.47 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  37.97 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  35.95 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  37.7 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0867  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.049042  normal  0.204791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  36.89 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.01 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  34.83 
 
 		 333 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  36.25 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>