More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0962 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  84.77 
 
 		 303 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  84.11 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  82.39 
 
 		 303 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  81.79 
 
 		 303 aa  522  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  81.4 
 
 		 303 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  77.56 
 
 		 303 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  57.1 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  56.44 
 
 		 313 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  55.45 
 
 		 305 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  55.78 
 
 		 304 aa  361  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  55.52 
 
 		 318 aa  358  6e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  55.78 
 
 		 305 aa  358  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  54.85 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  55.45 
 
 		 305 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  53.51 
 
 		 305 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  53.51 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  53.49 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  52.3 
 
 		 308 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  51.99 
 
 		 313 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  51.16 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  50.99 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  50.66 
 
 		 314 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  50.33 
 
 		 314 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  49 
 
 		 306 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  49.67 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  51 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  49.35 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  46.84 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  45.73 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  25.83 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  25.38 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  24.55 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.23 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  24.55 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  28.23 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.84 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.59 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.33 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  22.19 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  24.54 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  24.18 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  24.07 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  34.38 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.03 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.74 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  22.88 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  32.56 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  28.1 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.62 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.1 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  40 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.88 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  34.38 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  26.67 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  23.08 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.37 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  21.8 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.81 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.75 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  24.74 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.6 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.88 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  24.6 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  25.57 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.85 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  24.46 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  24.73 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.78 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.07 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 640 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  24.45 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  24.07 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  25.19 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  24.06 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.14 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>