128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3601 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3601  sugar isomerase family protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0687  phosphoheptose isomerase  42.55 
 
 
196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0792  SIS domain-containing protein  42.55 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5469  sugar isomerase family protein  47.8 
 
 
205 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3979  sugar isomerase family protein  48.13 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  27.13 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  28.93 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  32.68 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  31.07 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  28 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  30.43 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  30.82 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  25.56 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  31.41 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
672 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  28.12 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  25.65 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  31.01 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  27.57 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  34.44 
 
 
391 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  28.65 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  27.78 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  28.1 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  28.95 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  29.48 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  26.19 
 
 
186 aa  52  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  27.85 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  24.16 
 
 
204 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  30 
 
 
280 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.11 
 
 
650 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  28.42 
 
 
356 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  30.19 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  25.88 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  29.8 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  30.19 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  28.93 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  26.52 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  28.85 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  30.19 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  25.57 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  28.48 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  24.87 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  24.12 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  26.97 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  24.71 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  26.35 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  26.59 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  29.5 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  21.21 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  29.35 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  29.53 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  24.12 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  28.93 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  26.56 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  29.1 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  28.93 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  26.32 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  23.12 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  26.56 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  27.65 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  29.1 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  26.74 
 
 
198 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  29.1 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  27.32 
 
 
196 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  28.57 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  23.53 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  26.99 
 
 
358 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  26.99 
 
 
358 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  28.36 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  29.17 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  26.78 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  20.2 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  29.86 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  20.71 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  28.66 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  25.95 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  25.43 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  24.16 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  27.61 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  29.27 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  29.38 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  28.21 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>