59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3281 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1047 aa  2023    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  34.39 
 
 		 917 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  30.49 
 
 		 883 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1449  DNA repair ATPase  25.08 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000531143  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  34.15 
 
 		 767 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  34.15 
 
 		 767 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  34.96 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  34.15 
 
 		 974 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1284 aa  65.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.25 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  31.61 
 
 		 711 aa  63.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0028  hypothetical protein  38.4 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1351 aa  62.4  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1280 aa  60.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  37.04 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  29.66 
 
 		 664 aa  59.3  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  27.61 
 
 		 1171 aa  59.3  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1153 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1065 aa  55.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1053  SMC domain protein  27.59 
 
 		 1167 aa  55.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  32.2 
 
 		 724 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1047 aa  55.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  38.96 
 
 		 1181 aa  55.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  29.81 
 
 		 875 aa  55.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  31.71 
 
 		 973 aa  55.5  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  26.25 
 
 		 922 aa  55.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1158 aa  55.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  32.14 
 
 		 873 aa  55.1  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1149  SMC domain protein  30.39 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.166006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  25 
 
 		 922 aa  54.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  40 
 
 		 870 aa  53.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1282 aa  52.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  27.41 
 
 		 1179 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  30.28 
 
 		 787 aa  52  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  47.62 
 
 		 94 aa  51.6  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1160 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0999  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1167 aa  50.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1185 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1157 aa  50.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1348 aa  50.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  30.65 
 
 		 878 aa  49.7  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  32.58 
 
 		 901 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  26.54 
 
 		 902 aa  49.3  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6380  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1157 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717273  normal  0.28767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1210 aa  47.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  38.81 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1155 aa  48.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  30.56 
 
 		 830 aa  46.6  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2892  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1467 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3494  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1144 aa  46.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  31.01 
 
 		 712 aa  45.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0444  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1149 aa  45.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  40 
 
 		 874 aa  44.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>