More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2041 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  65.17 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
110 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  52.48 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  59.43 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  57.28 
 
 
125 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  59.8 
 
 
125 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  60.23 
 
 
114 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
109 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  53.98 
 
 
123 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  51.49 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  53.41 
 
 
110 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
115 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  54.44 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.69 
 
 
113 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 
113 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  55.68 
 
 
111 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  54.44 
 
 
114 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  41.58 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  42.53 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
93 aa  76.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  41.38 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  37.35 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  43.37 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  47.3 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  37.08 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  41.11 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.05 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  37.8 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  39 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  38.36 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  40.45 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  56.45 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
122 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
184 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  44.3 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  33.72 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  42.86 
 
 
218 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>