160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0226 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  100 
 
 
113 aa  224  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  52.25 
 
 
118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  38.6 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  39.6 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  41.58 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  40.59 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  40.59 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  40.59 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  40.59 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  39.6 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  36.79 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  34.75 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  39.83 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  40 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  36.89 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  35.29 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  39.6 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  39.64 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  36.44 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  45.13 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  41.41 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  46.99 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  30.77 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  29.36 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  33.66 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.59 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  39.22 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  34.74 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  39.6 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  29.36 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.33 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3763  YCII-related protein  40.62 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  37.93 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  33.91 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  35.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  41.11 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  36.63 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  29.7 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0227  YCII-related protein  47.22 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  35.29 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  34.58 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  35.96 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  34.65 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  30.69 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  29.37 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  32.67 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  34.65 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  37.27 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  36.54 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  33.01 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  38.55 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  46.38 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  40 
 
 
120 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  36.45 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  36.52 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  32.38 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  32.38 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  29.36 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  38.1 
 
 
260 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  33.04 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  45 
 
 
251 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  30.28 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  35.4 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.44 
 
 
126 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  33.01 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  33.01 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  33.01 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  35.09 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  34.52 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  53.49 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  28.71 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  28.81 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  34.69 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  33.93 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  46.97 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  31.58 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  38.24 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  29.2 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  39.71 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3192  YCII-related protein  23.85 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  32.69 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  32.08 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  34.19 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  34.94 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  51.22 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  40.32 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  36.14 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  33.71 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  37.18 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  34.83 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  31.3 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  33.04 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>