148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1379 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1379  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 129 aa  259  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1364  YCII-related  58.33 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.524126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  56.3 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  56.3 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  55.83 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  48.36 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  52.54 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  49.17 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3965  DGPFAETKE family protein  51.26 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.34547  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  52.94 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2858  DGPFAETKE family protein  48.33 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  46.67 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4188  DGPFAETKE family protein  46.61 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.974254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  51.26 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  40.34 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  37.27 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  40.52 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  35.09 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  30.63 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  32.17 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  32.77 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  31.3 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  37.07 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  30.88 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  35.96 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  35.34 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  34.48 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  30.97 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  32.74 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  32.76 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  31.9 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  31.3 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  35.56 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  29.82 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  36.78 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  34 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  40.58 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  31.03 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  38.16 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  38.16 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  38.16 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.62 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  33.62 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  34.51 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  39.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  37.78 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  36.47 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  35.38 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  37.97 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  31.9 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  37.23 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  37.8 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  48.21 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  42.47 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  30.17 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  35.48 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1553  YCII-related protein  38.57 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  43.55 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  38.81 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  44.9 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  35.96 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  36.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  37.63 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  32.46 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  35.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  34.41 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  34.12 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  34.48 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  38.3 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  34.09 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  32.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  29.46 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  31.9 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  34.62 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  33.33 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  37.35 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  35.23 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  36.23 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  35.51 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  38.03 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  35.56 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  30.84 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  26.72 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  32.93 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  35.42 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  32.61 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  38.37 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  32.58 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  38.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  28.7 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0508518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>