133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0227 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0227  YCII-related protein  100 
 
 
132 aa  262  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3763  YCII-related protein  41.82 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  40 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  36.67 
 
 
118 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  40.23 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  58.9  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  41.03 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  40.96 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  43.24 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  35.78 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  37.93 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  36.75 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  35.16 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0226  YCII-related protein  47.22 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  35.58 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  36.19 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  27.27 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.33 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  29.82 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.44 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  39.33 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  31.62 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 
114 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  38.57 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  40.85 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  35.2 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  44.64 
 
 
122 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  38.75 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  41.11 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  32.46 
 
 
122 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  35.9 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1474  DGPFAETKE domain-containing protein  44.83 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.847936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0959  DGPFAETKE family protein  33.72 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  31.58 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  36.62 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  41.43 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  32.77 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  39.19 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  36.84 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  34.83 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  46.58 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  36.59 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  34.74 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  34.74 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  34.74 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1110  YCII-related  33.72 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3354  DGPFAETKE family protein  36.9 
 
 
260 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526097  normal  0.294803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  40.3 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  34.52 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1952  YCII-related protein  37.63 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  32.11 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  42.7 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  30.56 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  39.29 
 
 
226 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  36.11 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  35.04 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  36.67 
 
 
120 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  29.51 
 
 
117 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  30.77 
 
 
118 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  36.47 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0022  hypothetical protein  40.58 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.346854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  31.52 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0828  DGPFAETKE family protein  44.64 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  37.04 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  48 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  27.93 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  48 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2089  YCII-related protein  32.61 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.796254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  48.89 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  27.59 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  37.31 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  35.16 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
389 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  34.38 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  35.71 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  32.14 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  36.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  36.84 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  32.14 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  34.12 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  36.78 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  30.14 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  43.33 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  32 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  31.71 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0003  DGPFAETKE family protein  42.11 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398282  hitchhiker  0.0000769661 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3455  YCII-related protein  37.93 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  25.89 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  31.25 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  31.25 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.276008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>