244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  378  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  74.39 
 
 		 184 aa  253  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  60.24 
 
 		 181 aa  201  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  53.76 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  51.37 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  51.11 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  50.27 
 
 		 183 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  49.73 
 
 		 183 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  50.54 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  51.38 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  52.15 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  50.28 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  47.49 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  46.93 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.87 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  48.35 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  45.81 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  52.98 
 
 		 249 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  53.09 
 
 		 180 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  49.7 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  53.01 
 
 		 188 aa  174  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.96 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  48.5 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  55.03 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50.6 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  49.38 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  51.5 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  49.38 
 
 		 208 aa  167  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  48.15 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  45.6 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  45.05 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  46.11 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  46.02 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  50.59 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  44.02 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  48 
 
 		 189 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  49.72 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  47.59 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  48.17 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  44.81 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  42.93 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  44.26 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  44.85 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  43.98 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  44.85 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  43.75 
 
 		 201 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  41.97 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  46.71 
 
 		 185 aa  156  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  44.68 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  45.14 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28080  hypothetical protein  51.52 
 
 		 132 aa  155  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  49.71 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  46.78 
 
 		 196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  49.71 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  41.8 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  42.93 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  41.08 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  45.4 
 
 		 195 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  44.13 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  45.78 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  38.62 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  41.75 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  44.85 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  43.65 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  43.82 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  37.31 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  38.86 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  41.36 
 
 		 197 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  53.95 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  42.16 
 
 		 187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40.51 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.22 
 
 		 196 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  44.57 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  42.41 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  44.02 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  42.5 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  42.68 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  43.35 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  47.5 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  46.63 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  41.36 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  41.52 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  43.68 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  41.62 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  43.68 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  39.8 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0867  hypothetical protein  43.68 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  41.62 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  37.44 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  45.4 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  43.68 
 
 		 180 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  43.79 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  38.86 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  40.2 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  40.1 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  44.97 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  40.1 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  45.7 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  41.72 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>