53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04160 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  100 
 
 		 339 aa  695    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  34.12 
 
 		 251 aa  146  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  36.51 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  33.48 
 
 		 248 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  31.3 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.43 
 
 		 490 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.52 
 
 		 558 aa  92.4  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  31.06 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  29.17 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  25.29 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.57 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  25.34 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  27.92 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  28.33 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  27.92 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  27.92 
 
 		 514 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  28.21 
 
 		 500 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  30.5 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  28 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  27.73 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  26.7 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  29.33 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  26.89 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.7 
 
 		 541 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  26.99 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  26.58 
 
 		 607 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  24.87 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  26.09 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  24.71 
 
 		 282 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  26.54 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  24.87 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  23.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30.22 
 
 		 974 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  24.91 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  24.3 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  23.2 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.01 
 
 		 533 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  22.75 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  22.71 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  25.12 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.61 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.64 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  20.91 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  22.45 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  23.53 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  29.41 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  24.24 
 
 		 271 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  22.48 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  21.78 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  24.3 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  25 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  22.93 
 
 		 548 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>