More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3434 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  60.55 
 
 		 517 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  70.38 
 
 		 507 aa  725    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 508 aa  1037    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  60.92 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  59.13 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  59.16 
 
 		 532 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  60.83 
 
 		 512 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  59.64 
 
 		 515 aa  609  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  58.79 
 
 		 525 aa  611  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  58.7 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  59.68 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  58.87 
 
 		 513 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  57.63 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  57.98 
 
 		 519 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  57.98 
 
 		 518 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  56.68 
 
 		 505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  58.55 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  56.68 
 
 		 505 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  58.47 
 
 		 516 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  56.28 
 
 		 505 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  56.54 
 
 		 499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  56.53 
 
 		 536 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  57.55 
 
 		 515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  59.15 
 
 		 513 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  57.11 
 
 		 541 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  55.18 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 536 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  57.83 
 
 		 516 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  56.11 
 
 		 521 aa  555  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  55.99 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  55.49 
 
 		 541 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  55.51 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  54.42 
 
 		 530 aa  548  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  57.09 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  55.89 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  55.53 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  53.19 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  52.18 
 
 		 522 aa  541  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  56.26 
 
 		 516 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  53.64 
 
 		 514 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  55.31 
 
 		 515 aa  545  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  53.64 
 
 		 546 aa  545  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 516 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 507 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  54.58 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  55.22 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  56.51 
 
 		 505 aa  535  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  55.09 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 539 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 539 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  54.65 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  53.71 
 
 		 513 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  53.91 
 
 		 508 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 518 aa  528  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  55.69 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  53.8 
 
 		 520 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  53.45 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  55.19 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  55.67 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  52.07 
 
 		 523 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  53.01 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  52.22 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  52.02 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  52.23 
 
 		 522 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 524 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  53.83 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  53.26 
 
 		 546 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  53.16 
 
 		 527 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  53.21 
 
 		 511 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  53.68 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  51.81 
 
 		 523 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2225  2-isopropylmalate synthase  55.28 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.324069  normal  0.905076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  53.68 
 
 		 514 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  53.56 
 
 		 515 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  53.96 
 
 		 511 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  53.68 
 
 		 514 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  52.4 
 
 		 519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  53.68 
 
 		 514 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  51.8 
 
 		 519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  49.14 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 555 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  52.33 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  54.27 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  53.68 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  52.95 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  52.71 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  51.47 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0561  2-isopropylmalate synthase  52.54 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.692388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1243  2-isopropylmalate synthase  51.14 
 
 		 568 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.75 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  52.1 
 
 		 519 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  51.91 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  54.49 
 
 		 527 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>