More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0448 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
275 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 
278 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
259 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
267 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
264 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  35.21 
 
 
260 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
269 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  37.35 
 
 
258 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.21 
 
 
264 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.29 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  35.44 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
259 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.72 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
271 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
264 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  31.88 
 
 
262 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 
280 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
260 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
296 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 
260 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 
286 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 
260 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
263 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
261 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
290 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  34.31 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.73 
 
 
306 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  29.17 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
289 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
264 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
211 aa  116  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
270 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
264 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.27 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
293 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.61 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 
269 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
260 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  29.82 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  36.99 
 
 
252 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 
268 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  32.01 
 
 
272 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  29.48 
 
 
263 aa  109  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  28.37 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  28.16 
 
 
282 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  28.16 
 
 
282 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  28.16 
 
 
282 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.33 
 
 
261 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
208 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  29.24 
 
 
295 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  31.17 
 
 
332 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 
269 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  29.24 
 
 
295 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  31.33 
 
 
301 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  34.01 
 
 
285 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  29.5 
 
 
281 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.1 
 
 
307 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
288 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  29.14 
 
 
310 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
283 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
285 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  31.31 
 
 
242 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
277 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.54 
 
 
285 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  35.54 
 
 
285 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  35.54 
 
 
285 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  38.65 
 
 
280 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  35.54 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  31.79 
 
 
285 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  31.09 
 
 
301 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>