233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5401 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  47.41 
 
 		 279 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  32.77 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  31.4 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  26.67 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  27.43 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  30.61 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  29.78 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  26.86 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  27.03 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  26.61 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  27.92 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  25.74 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  24.88 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  27.61 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  28.7 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.46 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  26.76 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.99 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  21.74 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.04 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  26.28 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  26.85 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  26.28 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 312 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 263 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  23.32 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  23.68 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0970  IclR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  26.9 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  22.95 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  24.57 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  20.09 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  23.49 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0997  IclR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  22.31 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  23.15 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>