More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4826 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  252  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.07 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.14 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  33 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.06 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.1 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.07 
 
 		 315 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.86 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.51 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.41 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.43 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  27.92 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.17 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.8 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.83 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.89 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.67 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  33.45 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.31 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  30 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  30.21 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.03 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.82 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.74 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  33.91 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.04 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  32.32 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.93 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.67 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.47 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  30.39 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  29.86 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.04 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.04 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.69 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.31 
 
 		 331 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  30.04 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.62 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  30.9 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  32.98 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.12 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  30.88 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.36 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  30.58 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  29.54 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  29.97 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  29.21 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  29.63 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  27.65 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.11 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.97 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  31.76 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.24 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  27.97 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.31 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  32.02 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  24.64 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  30.36 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29.12 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  33.49 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.16 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.05 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  24.64 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  24.64 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.01 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.47 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  29.43 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.42 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.72 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>