28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2433 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  48.6 
 
 
213 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  49.07 
 
 
213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  49.07 
 
 
213 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  46.8 
 
 
209 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  48.6 
 
 
213 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  44.81 
 
 
211 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  42.92 
 
 
206 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  46.99 
 
 
224 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  43.98 
 
 
208 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  47.37 
 
 
206 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  40.58 
 
 
211 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  43.01 
 
 
211 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  40.29 
 
 
233 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 
215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  40.19 
 
 
230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 
209 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  39.44 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  43.87 
 
 
214 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
223 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  57.78 
 
 
238 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  37.95 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  55 
 
 
170 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  51.09 
 
 
93 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  38.51 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  33.71 
 
 
243 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
767 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  23.9 
 
 
292 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>