201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1483 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
246 aa  474  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  43.44 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  44.38 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  31.36 
 
 
714 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  32.58 
 
 
714 aa  99  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  41.22 
 
 
746 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  34.52 
 
 
714 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 
732 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 
732 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 
732 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 
724 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  34.27 
 
 
735 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.71 
 
 
713 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  28.71 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  35.4 
 
 
717 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  33.64 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  27.71 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.57 
 
 
728 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38.57 
 
 
728 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.58 
 
 
701 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 
739 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  32.89 
 
 
739 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.5 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  34.48 
 
 
735 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  29.32 
 
 
720 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 
803 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  28.63 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.8 
 
 
738 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  27.01 
 
 
730 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.82 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  36.43 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  32.31 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.37 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  28.05 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.34 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.86 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  29.19 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.63 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  25.78 
 
 
219 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  28.36 
 
 
197 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  27.6 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.75 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  25.78 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  30.41 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  28.24 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  30.11 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  25.78 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.34 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  32.45 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  24.45 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  26.25 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.67 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  28.83 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  27.06 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  23.62 
 
 
215 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.14 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  27.63 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.85 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  28.22 
 
 
207 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.75 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  26.25 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  27.5 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  24.89 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  26.99 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  27.87 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  26.99 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  30.61 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  26.84 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  26.23 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.83 
 
 
746 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  27.47 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.19 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  28.34 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.11 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  29.83 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  31.15 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  26.52 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  24.06 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>