More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0390 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 502 aa  980    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  41.2 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  41.68 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.25 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  39.47 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 484 aa  262  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  36.13 
 
 		 506 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  40.95 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 466 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  34.99 
 
 		 474 aa  247  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 510 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 517 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 498 aa  243  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 541 aa  240  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  34.33 
 
 		 541 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  39.7 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  39.49 
 
 		 494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 519 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.79 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 760 aa  99.8  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 874 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  36.44 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.85 
 
 		 499 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 513 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.53 
 
 		 517 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 581 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 695 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  33.2 
 
 		 550 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  32.48 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  29.9 
 
 		 501 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 656 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1620  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.96029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  26.45 
 
 		 656 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05159  histidine kinase sensor protein  30.53 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  31.76 
 
 		 512 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  27.91 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 576 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 524 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 929 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 683 aa  91.3  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  32 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  28.9 
 
 		 528 aa  90.5  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  28.9 
 
 		 528 aa  90.5  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.79 
 
 		 541 aa  90.5  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 462 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 462 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 646 aa  90.1  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 814 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 572 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  33.21 
 
 		 577 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  31.88 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  29.06 
 
 		 548 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 577 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 548 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3166  two component sensor kinase  30.15 
 
 		 440 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  29.64 
 
 		 600 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 548 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 532 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 702 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2246  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.89 
 
 		 561 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  26.95 
 
 		 598 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 491 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>