More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3790 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0792  propionyl-CoA synthetase  53.11 
 
 		 626 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00519205  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  52.55 
 
 		 633 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  52.78 
 
 		 632 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1204  propionyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 630 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  52.16 
 
 		 630 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2037  propionyl-CoA synthetase  52.39 
 
 		 633 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1588  propionyl-CoA synthetase  52.22 
 
 		 666 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3965  propionyl-CoA synthetase  53.04 
 
 		 628 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0411  propionyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 628 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2900  propionyl-CoA synthetase  50.8 
 
 		 649 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.915781  normal  0.677321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  51.12 
 
 		 627 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0423  propionyl-CoA synthetase  50.95 
 
 		 628 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572013  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1339  propionyl-CoA synthetase  53.65 
 
 		 636 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 629 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0395  propionyl-CoA synthetase  54.62 
 
 		 631 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2691  propionyl-CoA synthetase  52.87 
 
 		 632 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 633 aa  1291    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  54.62 
 
 		 636 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0403  propionyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 628 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000502757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2513  propionyl-CoA synthetase  54.78 
 
 		 631 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0383  propionyl-CoA synthetase  52.72 
 
 		 626 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0465  propionyl-CoA synthetase  51.03 
 
 		 628 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0182759  hitchhiker  0.000616276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  51.75 
 
 		 625 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0405  propionyl-CoA synthetase  51.03 
 
 		 628 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1614  propionyl-CoA synthetase  52.95 
 
 		 630 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0263  propionyl-CoA synthetase  50.87 
 
 		 636 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.805785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2795  propionyl-CoA synthetase  53.18 
 
 		 634 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53121  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2322  propionyl-CoA synthetase  50.32 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2827  propionyl-CoA synthetase  51.96 
 
 		 641 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0366  propionyl-CoA synthetase  51.75 
 
 		 628 aa  628  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.708561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1804  propionyl-CoA synthetase  50.55 
 
 		 637 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.540364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00289  predicted propionyl-CoA synthetase with ATPase domain  51.35 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3271  propionate/CoA ligase  51.35 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0359  propionyl-CoA synthetase  51.58 
 
 		 628 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00293  hypothetical protein  51.35 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0406  propionyl-CoA synthetase  51.59 
 
 		 628 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1825  propionyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 631 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2016  propionyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 631 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143176  normal  0.377009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2170  propionyl-CoA synthetase  51.58 
 
 		 637 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2633  propionyl-CoA synthetase  51.57 
 
 		 641 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3290  propionyl-CoA synthetase  51.43 
 
 		 628 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0400  propionyl-CoA synthetase  51.03 
 
 		 628 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0899  propionyl-CoA synthetase  47.57 
 
 		 681 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1518  propionyl-CoA synthetase  47.87 
 
 		 681 aa  619  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.361962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0302  propionyl-CoA synthetase  47.19 
 
 		 670 aa  617  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  51.82 
 
 		 695 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0613  AMP-dependent synthetase and ligase  50.8 
 
 		 643 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  47.59 
 
 		 667 aa  606  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  47.43 
 
 		 666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  51.04 
 
 		 623 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 		 638 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2795  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 634 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 632 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  49.92 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 636 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 		 652 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  51.12 
 
 		 639 aa  595  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330038  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  48.57 
 
 		 638 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2844  AMP-dependent synthetase and ligase  48.96 
 
 		 652 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  49.28 
 
 		 638 aa  595  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  46.42 
 
 		 666 aa  589  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  47.78 
 
 		 631 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1532  AMP-dependent synthetase and ligase  48.8 
 
 		 652 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.589921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 625 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1364  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase  48.57 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 625 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  48.8 
 
 		 652 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 625 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  48.5 
 
 		 631 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1575  AMP-dependent synthetase and ligase  51.2 
 
 		 627 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 		 640 aa  585  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2826  AMP-dependent synthetase and ligase  48.48 
 
 		 652 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  48.33 
 
 		 656 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 		 632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  47.78 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  47.74 
 
 		 666 aa  581  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  48.25 
 
 		 634 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 638 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  46.32 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  47.63 
 
 		 631 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  47.3 
 
 		 637 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  47.9 
 
 		 670 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  45.41 
 
 		 636 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  49.44 
 
 		 644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1046  AMP-dependent synthetase and ligase  48.81 
 
 		 634 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  45.09 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  47.8 
 
 		 639 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 634 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  47.84 
 
 		 636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  48.25 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  46.73 
 
 		 668 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  44.78 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>