More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0872 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  61.59 
 
 		 662 aa  823    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  81.43 
 
 		 631 aa  1111    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1951  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 		 629 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2351  acetyl-CoA synthetase, putative  54.17 
 
 		 629 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  61.82 
 
 		 630 aa  833    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0917  acid-CoA ligase family protein  54.27 
 
 		 631 aa  735    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1731  propionate--CoA ligase  58.69 
 
 		 636 aa  775    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  59.01 
 
 		 636 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2844  AMP-dependent synthetase and ligase  59.39 
 
 		 652 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2671  AMP-dependent synthetase and ligase  55.95 
 
 		 624 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1532  AMP-dependent synthetase and ligase  59.55 
 
 		 652 aa  790    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.589921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  59.49 
 
 		 638 aa  788    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  59.55 
 
 		 640 aa  768    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.633526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  58.82 
 
 		 639 aa  753    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330038  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  60.38 
 
 		 634 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0956  propionate--CoA ligase  57.23 
 
 		 632 aa  771    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1592  acyl-CoA sythetase  61.34 
 
 		 638 aa  824    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1499  AMP-dependent synthetase and ligase  63.62 
 
 		 635 aa  867    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  86.83 
 
 		 631 aa  1167    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1067  AMP-dependent synthetase and ligase  59.49 
 
 		 642 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  85.24 
 
 		 640 aa  1169    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1673  propionate--CoA ligase  58.85 
 
 		 636 aa  778    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  58.2 
 
 		 644 aa  777    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 640 aa  1329    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  53.69 
 
 		 629 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1046  AMP-dependent synthetase and ligase  64.08 
 
 		 634 aa  867    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  60.8 
 
 		 632 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2795  AMP-dependent synthetase and ligase  58.87 
 
 		 634 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0245  AMP-dependent synthetase and ligase  61.34 
 
 		 630 aa  824    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  60.86 
 
 		 636 aa  815    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2622  AMP-dependent synthetase and ligase  53.47 
 
 		 642 aa  668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6467  AMP-dependent synthetase and ligase  57.97 
 
 		 627 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02393  hypothetical protein  56.91 
 
 		 626 aa  760    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  56.87 
 
 		 636 aa  761    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2298  AMP-dependent synthetase and ligase  59.71 
 
 		 633 aa  787    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1779  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 		 631 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4396  AMP-dependent synthetase and ligase  61.78 
 
 		 636 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  60.86 
 
 		 640 aa  805    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14120  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  54.26 
 
 		 651 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0156514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003392  propionate--CoA ligase  57.56 
 
 		 625 aa  770    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0273  AMP-dependent synthetase and ligase  62.14 
 
 		 630 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1797  AMP-dependent synthetase and ligase  54.24 
 
 		 641 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  60.7 
 
 		 636 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  59.55 
 
 		 641 aa  772    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3748  AMP-dependent synthetase and ligase  59.75 
 
 		 641 aa  796    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.159285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1575  AMP-dependent synthetase and ligase  60.87 
 
 		 627 aa  778    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1576  putative acetyl-coa synthetase  55.95 
 
 		 628 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1574  AMP-dependent synthetase and ligase  62.68 
 
 		 630 aa  838    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  53.76 
 
 		 634 aa  725    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  60.03 
 
 		 625 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  54.91 
 
 		 629 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2826  AMP-dependent synthetase and ligase  59.23 
 
 		 652 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  60.19 
 
 		 635 aa  790    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  60.03 
 
 		 640 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  56.25 
 
 		 632 aa  758    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  58.17 
 
 		 638 aa  781    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0613  AMP-dependent synthetase and ligase  60.22 
 
 		 643 aa  821    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  59.55 
 
 		 652 aa  790    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  61.81 
 
 		 695 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18150  putative acetyl-coa synthetase  56.11 
 
 		 628 aa  735    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4248  AMP-dependent synthetase and ligase  60.06 
 
 		 636 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.193877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1527  AMP-dependent synthetase and ligase  55.82 
 
 		 633 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.369396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  60.03 
 
 		 625 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2393  AMP-dependent synthetase and ligase  59.81 
 
 		 627 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000718613  hitchhiker  0.000862635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  59.37 
 
 		 635 aa  779    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  59.55 
 
 		 641 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1527  AMP-dependent synthetase and ligase  54.4 
 
 		 636 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1791  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 		 629 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.223336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  59.68 
 
 		 640 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  59.39 
 
 		 652 aa  789    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  86.67 
 
 		 637 aa  1177    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2225  AMP-dependent synthetase and ligase  62.56 
 
 		 634 aa  828    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  60.7 
 
 		 636 aa  814    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1958  AMP-dependent synthetase and ligase  59.3 
 
 		 643 aa  776    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1364  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase  57.58 
 
 		 644 aa  769    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  63.58 
 
 		 634 aa  850    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  82.99 
 
 		 631 aa  1129    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  60.03 
 
 		 625 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1865  AMP-dependent synthetase and ligase  56.16 
 
 		 628 aa  739    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.170173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  60.16 
 
 		 623 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  57.33 
 
 		 624 aa  748    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000665124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  59.58 
 
 		 638 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  87.19 
 
 		 640 aa  1197    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2043  AMP-dependent synthetase and ligase  56.89 
 
 		 638 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0081773  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  57.72 
 
 		 626 aa  723    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2234  AMP-dependent synthetase and ligase  58.19 
 
 		 643 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.573086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  49.76 
 
 		 625 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 633 aa  596  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  48.43 
 
 		 633 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2691  propionyl-CoA synthetase  48.34 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  48.27 
 
 		 632 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  48.59 
 
 		 636 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0792  propionyl-CoA synthetase  47.37 
 
 		 626 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00519205  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2037  propionyl-CoA synthetase  48.43 
 
 		 633 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1614  propionyl-CoA synthetase  47.15 
 
 		 630 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  46.43 
 
 		 627 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  48.08 
 
 		 629 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2322  propionyl-CoA synthetase  46.67 
 
 		 631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709656  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0899  propionyl-CoA synthetase  44.76 
 
 		 681 aa  561  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  47.78 
 
 		 630 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>