More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3965 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00289  predicted propionyl-CoA synthetase with ATPase domain  62.62 
 
 		 628 aa  809    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3271  propionate/CoA ligase  62.62 
 
 		 628 aa  810    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  68.41 
 
 		 632 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1825  propionyl-CoA synthetase  80.48 
 
 		 631 aa  1039    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2513  propionyl-CoA synthetase  72.23 
 
 		 631 aa  916    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0465  propionyl-CoA synthetase  62.52 
 
 		 628 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0182759  hitchhiker  0.000616276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0395  propionyl-CoA synthetase  72.07 
 
 		 631 aa  915    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0899  propionyl-CoA synthetase  52.44 
 
 		 681 aa  702    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1204  propionyl-CoA synthetase  63.16 
 
 		 630 aa  827    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0400  propionyl-CoA synthetase  62.3 
 
 		 628 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3290  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 628 aa  809    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  67.04 
 
 		 630 aa  860    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2900  propionyl-CoA synthetase  59.42 
 
 		 649 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.915781  normal  0.677321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3965  propionyl-CoA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1288    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2037  propionyl-CoA synthetase  67.46 
 
 		 633 aa  863    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0302  propionyl-CoA synthetase  53.37 
 
 		 670 aa  711    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 		 633 aa  663    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00293  hypothetical protein  62.62 
 
 		 628 aa  809    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1588  propionyl-CoA synthetase  64.21 
 
 		 666 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0792  propionyl-CoA synthetase  63.74 
 
 		 626 aa  828    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00519205  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  67.3 
 
 		 633 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2170  propionyl-CoA synthetase  69.21 
 
 		 637 aa  897    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2322  propionyl-CoA synthetase  75.48 
 
 		 631 aa  999    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1614  propionyl-CoA synthetase  63.64 
 
 		 630 aa  835    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0406  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 628 aa  810    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2633  propionyl-CoA synthetase  71.29 
 
 		 641 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1339  propionyl-CoA synthetase  65.02 
 
 		 636 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1518  propionyl-CoA synthetase  52.52 
 
 		 681 aa  694    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.361962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  67.26 
 
 		 629 aa  858    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0423  propionyl-CoA synthetase  62.36 
 
 		 628 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572013  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  61.4 
 
 		 636 aa  771    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0359  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 628 aa  810    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2795  propionyl-CoA synthetase  64.86 
 
 		 634 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53121  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0411  propionyl-CoA synthetase  62.52 
 
 		 628 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  63.94 
 
 		 625 aa  865    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2691  propionyl-CoA synthetase  72.97 
 
 		 632 aa  971    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0383  propionyl-CoA synthetase  56.41 
 
 		 626 aa  717    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0263  propionyl-CoA synthetase  74.17 
 
 		 636 aa  983    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.805785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0405  propionyl-CoA synthetase  62.52 
 
 		 628 aa  821    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0403  propionyl-CoA synthetase  62.52 
 
 		 628 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000502757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  66.13 
 
 		 627 aa  878    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2827  propionyl-CoA synthetase  76.38 
 
 		 641 aa  970    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1804  propionyl-CoA synthetase  70.84 
 
 		 637 aa  940    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.540364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2016  propionyl-CoA synthetase  80.48 
 
 		 631 aa  1039    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143176  normal  0.377009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0366  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 628 aa  809    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.708561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  52.25 
 
 		 695 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  48.34 
 
 		 636 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  48.18 
 
 		 636 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  47.86 
 
 		 636 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 632 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  48.42 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3748  AMP-dependent synthetase and ligase  47.96 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.159285  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  47.15 
 
 		 631 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  48.17 
 
 		 636 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  47.63 
 
 		 631 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2043  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 638 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0081773  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  47.07 
 
 		 632 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  48.96 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  48.96 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  49.68 
 
 		 641 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  48.97 
 
 		 631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  46.6 
 
 		 634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4396  AMP-dependent synthetase and ligase  47.86 
 
 		 636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  46.5 
 
 		 634 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2393  AMP-dependent synthetase and ligase  49.84 
 
 		 627 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000718613  hitchhiker  0.000862635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  48.97 
 
 		 662 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6467  AMP-dependent synthetase and ligase  50.32 
 
 		 627 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1958  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 		 643 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  47.78 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  48.48 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  50.16 
 
 		 625 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  49.01 
 
 		 641 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  47.13 
 
 		 629 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 638 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1499  AMP-dependent synthetase and ligase  46.92 
 
 		 635 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  47.45 
 
 		 629 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1364  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase  48.4 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2234  AMP-dependent synthetase and ligase  48.08 
 
 		 643 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.573086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  49.44 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.633526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1779  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 		 631 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1067  AMP-dependent synthetase and ligase  48.02 
 
 		 642 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1576  putative acetyl-coa synthetase  48.56 
 
 		 628 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2795  AMP-dependent synthetase and ligase  46.84 
 
 		 634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0956  propionate--CoA ligase  46.96 
 
 		 632 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18150  putative acetyl-coa synthetase  48.72 
 
 		 628 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2351  acetyl-CoA synthetase, putative  48.33 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 652 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 		 634 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1532  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 652 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.589921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  46.18 
 
 		 637 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  49.37 
 
 		 623 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1951  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 		 629 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2826  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 		 652 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 640 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2844  AMP-dependent synthetase and ligase  47.04 
 
 		 652 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 638 aa  557  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 		 624 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000665124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>