More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1562 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00289  predicted propionyl-CoA synthetase with ATPase domain  59.46 
 
 		 628 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3271  propionate/CoA ligase  59.46 
 
 		 628 aa  799    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0302  propionyl-CoA synthetase  52.36 
 
 		 670 aa  727    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  65.23 
 
 		 633 aa  880    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  63.8 
 
 		 632 aa  858    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0899  propionyl-CoA synthetase  52.82 
 
 		 681 aa  725    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1204  propionyl-CoA synthetase  64.75 
 
 		 630 aa  867    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0465  propionyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 628 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0182759  hitchhiker  0.000616276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  67.52 
 
 		 630 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1588  propionyl-CoA synthetase  63.74 
 
 		 666 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1825  propionyl-CoA synthetase  64.7 
 
 		 631 aa  863    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2795  propionyl-CoA synthetase  61.56 
 
 		 634 aa  817    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53121  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0405  propionyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 628 aa  814    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0403  propionyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 628 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000502757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2170  propionyl-CoA synthetase  66.3 
 
 		 637 aa  856    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0792  propionyl-CoA synthetase  59.17 
 
 		 626 aa  804    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00519205  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0400  propionyl-CoA synthetase  59.14 
 
 		 628 aa  795    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0423  propionyl-CoA synthetase  59.62 
 
 		 628 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572013  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2322  propionyl-CoA synthetase  68.36 
 
 		 631 aa  922    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2900  propionyl-CoA synthetase  55.43 
 
 		 649 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.915781  normal  0.677321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0411  propionyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 628 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2633  propionyl-CoA synthetase  65.4 
 
 		 641 aa  853    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1339  propionyl-CoA synthetase  61.72 
 
 		 636 aa  819    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1518  propionyl-CoA synthetase  52.82 
 
 		 681 aa  721    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.361962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  66.67 
 
 		 629 aa  876    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0359  propionyl-CoA synthetase  59.46 
 
 		 628 aa  799    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2016  propionyl-CoA synthetase  64.7 
 
 		 631 aa  863    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143176  normal  0.377009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  100 
 
 		 625 aa  1291    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0263  propionyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 636 aa  825    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.805785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  59.84 
 
 		 636 aa  798    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2037  propionyl-CoA synthetase  65.55 
 
 		 633 aa  867    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3965  propionyl-CoA synthetase  63.94 
 
 		 628 aa  847    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1804  propionyl-CoA synthetase  64.56 
 
 		 637 aa  875    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.540364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  78.01 
 
 		 627 aa  1062    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2513  propionyl-CoA synthetase  66.88 
 
 		 631 aa  870    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0395  propionyl-CoA synthetase  66.88 
 
 		 631 aa  872    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0406  propionyl-CoA synthetase  59.3 
 
 		 628 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0366  propionyl-CoA synthetase  59.78 
 
 		 628 aa  801    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.708561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0383  propionyl-CoA synthetase  58.04 
 
 		 626 aa  750    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2827  propionyl-CoA synthetase  60.47 
 
 		 641 aa  820    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1614  propionyl-CoA synthetase  64.17 
 
 		 630 aa  854    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3290  propionyl-CoA synthetase  59.14 
 
 		 628 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2691  propionyl-CoA synthetase  69.11 
 
 		 632 aa  935    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00293  hypothetical protein  59.46 
 
 		 628 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  51.75 
 
 		 633 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2043  AMP-dependent synthetase and ligase  50.79 
 
 		 638 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0081773  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  51.11 
 
 		 695 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 631 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  49.52 
 
 		 632 aa  608  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  50.4 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  49.6 
 
 		 636 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  50.4 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  50.4 
 
 		 625 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  49.76 
 
 		 636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  49.21 
 
 		 634 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 631 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  49.76 
 
 		 640 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  49.52 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 		 652 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2844  AMP-dependent synthetase and ligase  48.96 
 
 		 652 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 		 652 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 		 634 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1532  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 		 652 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.589921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 		 637 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2393  AMP-dependent synthetase and ligase  50.72 
 
 		 627 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000718613  hitchhiker  0.000862635 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  49.6 
 
 		 640 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  49.76 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  48.57 
 
 		 636 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  49.44 
 
 		 623 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  48.97 
 
 		 631 aa  593  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2826  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 		 652 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 		 632 aa  595  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  47.37 
 
 		 638 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  48.01 
 
 		 629 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  47.69 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  49.12 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330038  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  46.35 
 
 		 634 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003392  propionate--CoA ligase  48.81 
 
 		 625 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3748  AMP-dependent synthetase and ligase  48.19 
 
 		 641 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.159285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0917  acid-CoA ligase family protein  48.25 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 638 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6467  AMP-dependent synthetase and ligase  49.28 
 
 		 627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2298  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 		 633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4396  AMP-dependent synthetase and ligase  49.05 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 		 635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 		 640 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0956  propionate--CoA ligase  48.88 
 
 		 632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1364  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase  47.21 
 
 		 644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1673  propionate--CoA ligase  47.3 
 
 		 636 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1592  acyl-CoA sythetase  48.01 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0613  AMP-dependent synthetase and ligase  47.27 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0273  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 		 630 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  48.1 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0245  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 		 630 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  47.44 
 
 		 640 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1779  AMP-dependent synthetase and ligase  49.2 
 
 		 631 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2795  AMP-dependent synthetase and ligase  48.08 
 
 		 634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1731  propionate--CoA ligase  47.14 
 
 		 636 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  46.72 
 
 		 638 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>