More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0400 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00289  predicted propionyl-CoA synthetase with ATPase domain  99.52 
 
 		 628 aa  1289    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3271  propionate/CoA ligase  99.36 
 
 		 628 aa  1287    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1729  propionyl-CoA synthetase  62.14 
 
 		 633 aa  816    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264678  normal  0.844585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3290  propionyl-CoA synthetase  99.36 
 
 		 628 aa  1288    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0395  propionyl-CoA synthetase  63.42 
 
 		 631 aa  816    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1518  propionyl-CoA synthetase  62.84 
 
 		 632 aa  826    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0423  propionyl-CoA synthetase  89.81 
 
 		 628 aa  1183    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572013  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0899  propionyl-CoA synthetase  50.61 
 
 		 681 aa  693    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1204  propionyl-CoA synthetase  61.24 
 
 		 630 aa  815    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3965  propionyl-CoA synthetase  62.3 
 
 		 628 aa  804    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2185  propionyl-CoA synthetase  64.15 
 
 		 630 aa  819    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238065  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1562  propionyl-CoA synthetase  59.14 
 
 		 625 aa  813    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3790  AMP-dependent synthetase and ligase  51.43 
 
 		 633 aa  637    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.20899  decreased coverage  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1588  propionyl-CoA synthetase  61.5 
 
 		 666 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0411  propionyl-CoA synthetase  89.97 
 
 		 628 aa  1186    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2691  propionyl-CoA synthetase  62.02 
 
 		 632 aa  827    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0359  propionyl-CoA synthetase  99.52 
 
 		 628 aa  1290    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0366  propionyl-CoA synthetase  98.73 
 
 		 628 aa  1281    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.708561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2322  propionyl-CoA synthetase  62.64 
 
 		 631 aa  835    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2633  propionyl-CoA synthetase  64.23 
 
 		 641 aa  812    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1339  propionyl-CoA synthetase  62.36 
 
 		 636 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0302  propionyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 670 aa  704    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1518  propionyl-CoA synthetase  50 
 
 		 681 aa  689    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.361962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2203  propionyl-CoA synthetase  64.63 
 
 		 629 aa  821    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1689  propionyl-CoA synthetase  58.47 
 
 		 636 aa  739    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1825  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 631 aa  810    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2900  propionyl-CoA synthetase  55.82 
 
 		 649 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.915781  normal  0.677321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0792  propionyl-CoA synthetase  58.53 
 
 		 626 aa  775    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00519205  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0400  propionyl-CoA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1296    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2795  propionyl-CoA synthetase  61.31 
 
 		 634 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53121  normal  0.243025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0406  propionyl-CoA synthetase  99.36 
 
 		 628 aa  1287    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2037  propionyl-CoA synthetase  61.82 
 
 		 633 aa  799    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0383  propionyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 626 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0403  propionyl-CoA synthetase  89.81 
 
 		 628 aa  1184    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000502757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2513  propionyl-CoA synthetase  63.26 
 
 		 631 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1614  propionyl-CoA synthetase  59.49 
 
 		 630 aa  786    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1020  propionyl-CoA synthetase  59.78 
 
 		 627 aa  825    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0465  propionyl-CoA synthetase  89.97 
 
 		 628 aa  1187    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0182759  hitchhiker  0.000616276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0405  propionyl-CoA synthetase  89.81 
 
 		 628 aa  1185    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2827  propionyl-CoA synthetase  60.88 
 
 		 641 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1804  propionyl-CoA synthetase  63.67 
 
 		 637 aa  827    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.540364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2170  propionyl-CoA synthetase  64.07 
 
 		 637 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0671437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2016  propionyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 631 aa  810    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143176  normal  0.377009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00293  hypothetical protein  99.52 
 
 		 628 aa  1289    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0263  propionyl-CoA synthetase  61.37 
 
 		 636 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.805785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  48.73 
 
 		 695 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1396  AMP-dependent synthetase and ligase  46.91 
 
 		 632 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.792119  normal  0.172808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0878  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000235453  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4609  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 625 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  46.2 
 
 		 634 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2043  AMP-dependent synthetase and ligase  46.59 
 
 		 638 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0081773  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4231  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 625 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4297  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 625 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0348009  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  46.6 
 
 		 631 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0943  putative propionate--CoA ligase  45.01 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4221  AMP-dependent synthetase and ligase  44.78 
 
 		 636 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409374  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2393  AMP-dependent synthetase and ligase  48.81 
 
 		 627 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000718613  hitchhiker  0.000862635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  46.12 
 
 		 636 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.918913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  46.55 
 
 		 634 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10660  acetyl-CoA synthetase  44.65 
 
 		 629 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0872  AMP-dependent synthetase and ligase  45.91 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1171  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 		 640 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.263452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1125  propionate--CoA ligase  46.21 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4326  AMP-dependent synthetase and ligase  44.85 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2725  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0122187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6467  AMP-dependent synthetase and ligase  46.99 
 
 		 627 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  45.02 
 
 		 644 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1731  propionate--CoA ligase  45.17 
 
 		 636 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 		 629 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1288  propionate--CoA ligase  47.55 
 
 		 631 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1673  propionate--CoA ligase  45.17 
 
 		 636 aa  527  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  44.89 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4996  AMP-dependent synthetase and ligase  44.53 
 
 		 636 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0613  AMP-dependent synthetase and ligase  45.76 
 
 		 643 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1460  AMP-dependent synthetase and ligase  44.41 
 
 		 638 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003392  propionate--CoA ligase  45.24 
 
 		 625 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3748  AMP-dependent synthetase and ligase  44.34 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.159285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  45.69 
 
 		 641 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 		 635 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  45.97 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  45.73 
 
 		 623 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0956  propionate--CoA ligase  44.53 
 
 		 632 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0273  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 630 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2298  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 		 633 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  46.12 
 
 		 639 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330038  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1958  AMP-dependent synthetase and ligase  44.41 
 
 		 643 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1675  AMP-dependent synthetase and ligase  44.57 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2351  acetyl-CoA synthetase, putative  44.9 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  44.78 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0245  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 		 630 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1592  acyl-CoA sythetase  44.3 
 
 		 638 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2234  AMP-dependent synthetase and ligase  44.25 
 
 		 643 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.573086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1576  putative acetyl-coa synthetase  44.69 
 
 		 628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 		 652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3221  AMP-dependent synthetase and ligase  44.2 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0171767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471619  hitchhiker  0.000000265688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4396  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 		 636 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02393  hypothetical protein  44.85 
 
 		 626 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  44.5 
 
 		 662 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1067  AMP-dependent synthetase and ligase  44.41 
 
 		 642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>