More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2894 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
265 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  39 
 
 
288 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.71 
 
 
269 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 
269 aa  165  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  31.73 
 
 
254 aa  164  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  34.01 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.79 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
258 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 
269 aa  162  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
257 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5218  transcriptional regulator, DeoR family  34.69 
 
 
253 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439257 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5481  transcriptional regulator, DeoR family  34.69 
 
 
253 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.21489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.28 
 
 
250 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
274 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.89 
 
 
257 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  35.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  35.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35.16 
 
 
257 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  35.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  35.16 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.55 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.48 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
258 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.73 
 
 
258 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.73 
 
 
258 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.48 
 
 
257 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.48 
 
 
257 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
256 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.08 
 
 
257 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
260 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  34.12 
 
 
259 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  34.12 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  34.12 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  34.12 
 
 
257 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.08 
 
 
257 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.73 
 
 
259 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.6 
 
 
258 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.59 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.68 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
267 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
254 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
261 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
261 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.45 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  33.06 
 
 
263 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
266 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 
290 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  34.04 
 
 
270 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 
254 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.91 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
259 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  32.82 
 
 
263 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
284 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 
255 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  34.54 
 
 
257 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 
254 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 
252 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  32.43 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  35.89 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0857  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  32.92 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 
269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>