More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1616 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  100 
 
 		 332 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  71.69 
 
 		 331 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  65.43 
 
 		 324 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  64.44 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  69.3 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  64.92 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  56.27 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  63.04 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  55.56 
 
 		 328 aa  391  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  53.09 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  54.94 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  54.52 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  56.13 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  52.47 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.58 
 
 		 449 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  56.48 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  53.4 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  55.86 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  51.85 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  52.47 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  54.01 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.23 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  54.49 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  53.54 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  54.94 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  54.21 
 
 		 330 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.29 
 
 		 467 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.61 
 
 		 467 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.87 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.23 
 
 		 468 aa  361  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  51.54 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  50 
 
 		 325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  52 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.63 
 
 		 456 aa  354  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.39 
 
 		 482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.77 
 
 		 483 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.08 
 
 		 469 aa  351  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.41 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.53 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.05 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.15 
 
 		 461 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.1 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.39 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.85 
 
 		 448 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.1 
 
 		 456 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.85 
 
 		 465 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.38 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.46 
 
 		 480 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.54 
 
 		 454 aa  342  4e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  53.56 
 
 		 469 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  50.16 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.78 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.78 
 
 		 497 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  51.08 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.53 
 
 		 480 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.32 
 
 		 458 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.47 
 
 		 466 aa  338  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.54 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.15 
 
 		 451 aa  335  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.48 
 
 		 463 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.48 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.81 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  48.44 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.22 
 
 		 456 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.32 
 
 		 332 aa  332  6e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2759  pyruvate dehydrogenase subunit beta  52.32 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.884776  hitchhiker  0.000123714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  51.15 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68238  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (PDH)  49.54 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.22 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.85 
 
 		 456 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  48.61 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  49.24 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.15 
 
 		 461 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20183  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  46.44 
 
 		 360 aa  318  7e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  49.69 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  49.69 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  49.69 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  48 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.13 
 
 		 464 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  50.78 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  48 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  48.46 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  47.69 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  47.69 
 
 		 326 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.85 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  50.77 
 
 		 466 aa  315  8e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.75 
 
 		 320 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.53 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  49.22 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09403  pyruvate dehydrogenase E1 component, beta subunit (Eurofung)  46.32 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  46.37 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  50.92 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  50.92 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0386  transketolase  50.16 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3467  Transketolase central region  49.07 
 
 		 335 aa  305  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.538791  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  50.15 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  46.08 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1489  Transketolase central region  50.31 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>