More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1104 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  44.48 
 
 
313 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  36.79 
 
 
298 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  38 
 
 
301 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  37.87 
 
 
299 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  39.74 
 
 
316 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  39.47 
 
 
309 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  39.41 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  37.21 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  36.98 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  40.72 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  39.23 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  38.76 
 
 
315 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  36.58 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  41.04 
 
 
316 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  37.58 
 
 
299 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  37.54 
 
 
319 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  38.11 
 
 
315 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  37.17 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  35.95 
 
 
301 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  35.62 
 
 
301 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 
323 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  37.21 
 
 
319 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  37 
 
 
345 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  35 
 
 
313 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  35.12 
 
 
317 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  37.86 
 
 
325 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  36.3 
 
 
315 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 
306 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 
316 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  36.54 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  36.91 
 
 
310 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.88 
 
 
305 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 
302 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  27.21 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 
305 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  34.54 
 
 
303 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  36.67 
 
 
280 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
312 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.52 
 
 
329 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  32.25 
 
 
309 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
311 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
311 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  37.13 
 
 
294 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31.92 
 
 
309 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  33.11 
 
 
303 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  35.29 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  28.97 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  31.49 
 
 
312 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  35.28 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
314 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
296 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  38.03 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  36.6 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  34.63 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  33.01 
 
 
310 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.28 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
311 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  35.81 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 
306 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  41.04 
 
 
336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  31.27 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  31.35 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
318 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  33.1 
 
 
303 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.87 
 
 
307 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32 
 
 
307 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
296 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  31.9 
 
 
338 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 
296 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  33.98 
 
 
282 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
318 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
315 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.12 
 
 
337 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  32.69 
 
 
309 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  34.21 
 
 
283 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 
307 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
322 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 
306 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 
343 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 
280 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 
314 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>