73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0224 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 346 aa  712    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  66.27 
 
 		 346 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  64.18 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  63.14 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  60.98 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  58.96 
 
 		 349 aa  441  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  56.12 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.29 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.72 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.44 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 334 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.02 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.88 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  22.84 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.41 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  22.96 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  20.29 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.24 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.01 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.95 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.95 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.23 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.23 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.92 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.01 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.71 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  22.98 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  27.47 
 
 		 419 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  26.47 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  21.02 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.84 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.94 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  28.24 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  29.86 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.31 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  28.34 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.85 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.86 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  22.99 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  21.57 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  27.53 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  22 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  21.58 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>