214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5566 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  54.15 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  48.07 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  43.06 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  48.53 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  45.85 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  45.2 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  43.68 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  45.13 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  44.29 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  44.13 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  44.48 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  41.16 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  40.64 
 
 		 317 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  40.58 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  41.76 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  43.32 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  42.96 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.58 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  40.57 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  43.32 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  44.02 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.32 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  42.5 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  41.58 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.47 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  42.32 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.85 
 
 		 302 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  40.58 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  37.54 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  39.7 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  42.23 
 
 		 257 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  39.43 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  40.07 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  35.29 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  40.84 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  38.06 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  40.22 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  39.72 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  39.57 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  37.81 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  38.63 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  40.07 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  40.54 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 304 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  32.13 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  39.63 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.28 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  38.32 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  39.64 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.99 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  38.41 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  43.07 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  40.14 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  38.79 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>