204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4858 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4858  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
597 aa  1199    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3690  glycoside hydrolase 15-related  56.43 
 
 
593 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190476  normal  0.0841535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0382  glycoside hydrolase 15-related  56.68 
 
 
611 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1183  glycoside hydrolase 15-related  54.19 
 
 
616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1076  glycoside hydrolase 15-related  54.12 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000337356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0307  glycoside hydrolase 15-related  54.67 
 
 
583 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00932548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2494  glycoside hydrolase 15-related  53.87 
 
 
603 aa  534  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.66 
 
 
600 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.77 
 
 
602 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.43 
 
 
602 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.93 
 
 
850 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  32.51 
 
 
601 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  32.44 
 
 
659 aa  207  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  30.16 
 
 
594 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  31.84 
 
 
605 aa  203  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.87 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  31 
 
 
617 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  31.57 
 
 
611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  31.81 
 
 
867 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.51 
 
 
602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  32.58 
 
 
627 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  29.45 
 
 
677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  29.45 
 
 
677 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  29.45 
 
 
677 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  29.52 
 
 
672 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
867 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  30.85 
 
 
586 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  31.07 
 
 
602 aa  196  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  29.92 
 
 
645 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  31.46 
 
 
786 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  31.73 
 
 
613 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  29.26 
 
 
619 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  31.67 
 
 
596 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  30.62 
 
 
598 aa  193  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  29.95 
 
 
612 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  30.83 
 
 
867 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  28.81 
 
 
608 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.45 
 
 
597 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  29.59 
 
 
642 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  30.86 
 
 
602 aa  190  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  30.18 
 
 
636 aa  190  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  31.56 
 
 
609 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  29.32 
 
 
668 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  30.02 
 
 
595 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  30.44 
 
 
617 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  31.99 
 
 
611 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  32.22 
 
 
600 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  32.1 
 
 
842 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  30.69 
 
 
601 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  30.46 
 
 
844 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  29.05 
 
 
598 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
608 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  31.86 
 
 
626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  31.66 
 
 
609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  29.98 
 
 
635 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.42 
 
 
610 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  29.32 
 
 
662 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.83 
 
 
609 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 
605 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  31.48 
 
 
604 aa  184  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  29.48 
 
 
868 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  31.08 
 
 
609 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  31.08 
 
 
609 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  29.33 
 
 
605 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  29.26 
 
 
600 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  29.51 
 
 
601 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  30.67 
 
 
614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  29.28 
 
 
619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  30.59 
 
 
665 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  29.28 
 
 
619 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  29.88 
 
 
598 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  31.63 
 
 
593 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  28.83 
 
 
609 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  30.92 
 
 
609 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  29.44 
 
 
602 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  30.62 
 
 
623 aa  180  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  30.27 
 
 
629 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  30.36 
 
 
639 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  30.34 
 
 
616 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  30.08 
 
 
607 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  29.56 
 
 
847 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  29.21 
 
 
679 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  30.83 
 
 
626 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  30.37 
 
 
628 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  30.1 
 
 
629 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  29.15 
 
 
616 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  29.59 
 
 
608 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  31.53 
 
 
596 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  28.38 
 
 
626 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  30.71 
 
 
610 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  30.71 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  29.72 
 
 
636 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  28.62 
 
 
599 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  27.93 
 
 
594 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>