More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3681 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3681  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
474 aa  905    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  51.31 
 
 
457 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8497  putative transcriptional regulator, GntR family  51.55 
 
 
481 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4657  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.24 
 
 
481 aa  339  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379669  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  49.43 
 
 
470 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0200  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.14 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5231  putative transcriptional regulator, GntR family  46.42 
 
 
466 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3666  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.07 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2490  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.75 
 
 
471 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0316891  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.61 
 
 
479 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0577831  normal  0.070905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8727  putative transcriptional regulator, GntR family  45.91 
 
 
473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1658  regulatory protein GntR HTH  43.36 
 
 
498 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8887  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.08 
 
 
476 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3012  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.1 
 
 
486 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4809  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.03 
 
 
508 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.367164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.83 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1181  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
474 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.969384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
480 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 
470 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.14 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5625  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 
467 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5379  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
452 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.696679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4998  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
452 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.434701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5086  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
452 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8902  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.45 
 
 
492 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.12 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.21 
 
 
500 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
477 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4531  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.23 
 
 
529 aa  249  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.601015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.86 
 
 
488 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.87 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
473 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.45 
 
 
491 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.91 
 
 
476 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
488 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
493 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.04 
 
 
472 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
507 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
516 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
490 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  32.29 
 
 
463 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1430  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
474 aa  236  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.149047 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  37.82 
 
 
520 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.06 
 
 
516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.96 
 
 
497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
569 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
466 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.08 
 
 
494 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
444 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.75 
 
 
497 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
444 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.5 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.12 
 
 
503 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.5 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.95 
 
 
486 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
509 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  36.95 
 
 
509 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
502 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
473 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
502 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  34.64 
 
 
501 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.29 
 
 
474 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0410  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.11 
 
 
503 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
488 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
475 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.03 
 
 
501 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
492 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.3 
 
 
472 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  39.39 
 
 
502 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.77 
 
 
471 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
501 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 
479 aa  230  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
501 aa  230  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 
496 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.04 
 
 
489 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
484 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
493 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
485 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
466 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  29 
 
 
463 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.53 
 
 
510 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  36.94 
 
 
477 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  30.44 
 
 
466 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
497 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  34.71 
 
 
508 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.96 
 
 
515 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.59 
 
 
464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
492 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.24 
 
 
508 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 
466 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 
444 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.74 
 
 
465 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
466 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  30.44 
 
 
466 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>