More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3266 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 426 aa  844    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  51.76 
 
 		 431 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  53.48 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  49.17 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  49.88 
 
 		 441 aa  382  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  36.43 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.07 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 611 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.01 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.58 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.49 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  31.41 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.35 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  29.78 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  33.01 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  29.25 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  33.17 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 498 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  31.48 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  29.15 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.29 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  34.3 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  34.3 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.85 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  30.86 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  34.3 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  28.5 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  28.28 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  28.28 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0892  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 367 aa  140  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  27.78 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  27.34 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  32.75 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  29.29 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  30.42 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  28.79 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  26.27 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 340 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  33 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  30.71 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0977  putative transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.664602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  28.79 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  28.79 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  28.79 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>